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虽然克唑替尼在肺癌治疗中显示出良好的疗效，但仍存在一些副作用和安全性的问题。常见的副作用包括皮疹、腹泻、疲劳等，且在个体间表现差异较大。此外，由于克唑替尼靶向的是一些正常细胞也会表达的激酶，因此可能对正常组织造成不良影响。为了保证患者的安全性，临床医生需要密切监测患者的副作用情况，并及时调整治疗方案。

克唑替尼在一些患者中会出现耐药现象，这限制了其长期治疗效果。近年来，研究人员对克唑替尼耐药机制进行了深入研究，发现一些常见的耐药突变和信号通路变化。例如，EGFR T790M突变和MET增强等是克唑替尼耐药的常见机制。基于这些研究成果，一些新型的靶向药物已经得到开发，并在临床试验中显示出一定的疗效。